torsdag 27 september 2012

Dag 4. Stringenstvätt och detektion

Idag har membranet som blottades blivit tvättat och hybridiserat med prober för att detekteras.
Metoden att detektera med probe kan användas på mycket små mängder av DNA, till skillnad från elektrofores som kräver större mängder för att kunna ses med UV-ljus.

Resultatet såg ut som följande efter inkubation i mörker:
I kolumnen längst till vänster finns den oklyvda plasmiden. Därefter kommer den klyvda plasmiden(5mikrogram) och längst bort finns den klyvda plasmiden (0,005 mikrogram).
De tjockaste banden i de två första kolumnerna är de som innehåller mest LL-37.
Det förekommer även lite ospecifika hybridiseringar av prober som inte blivit helt borttvättade i stringenstvätten, men utgör inget större hinder i bedömningen då banden med LL-37 är så starka i jämförelse.

Till skillnad från elektroforesen så är band synliga vid den lägsta koncentrationen av klyvd plasmid, vilket visar på att probe-detektion är väldigt effektiv även vid mindre mängder.

Vi har påvisat återigen att vi LL-37 genen.

Jag vill tacka min labbpartner för en väl utförd laboration med strålande resultat.

2 kommentarer:

  1. Hej!
    Du har gjort bra tolkningar av era resultat men jag ser ingen diskussion av för och nackdelar med PCR respektive southern blot :)

    SvaraRadera
  2. Hej Sara!
    Du har fått ett bra resultat.Du har lyckats med stringestvätt p.g.a det finns inget band i M III och M IX .
    Under dag 4 har vi gjort den klyvda plasmiden med (0,5 mikrogram)och inte (5 mikrogram).Och jag håller med petra att du inte diskuterar
    nackdelar och fördelar med PCR respektive southern blot.

    SvaraRadera